Python求兩個字符串最長公共子序列代碼實(shí)例
一、問題描述
給定兩個字符串,求解這兩個字符串的最長公共子序列(Longest Common Sequence)。比如字符串1:BDCABA;字符串2:ABCBDAB。則這兩個字符串的最長公共子序列長度為4,最長公共子序列是:BCBA
二、算法求解
這是一個動態(tài)規(guī)劃的題目。對于可用動態(tài)規(guī)劃求解的問題,一般有兩個特征:①最優(yōu)子結(jié)構(gòu);②重疊子問題
①最優(yōu)子結(jié)構(gòu)
設(shè)X=(x1,x2,...,xn)和Y=(y1,y2,...,ym)是兩個序列,將X和Y的最長公共子序列記為LCS(X,Y)
找出LCS(X,Y)就是一個最優(yōu)化問題。因?yàn)椋覀冃枰业絏和Y中最長的那個公共子序列。而要找X和Y的LCS,首先考慮X的最后一個元素和Y的最后一個元素。
⑴如果xn=ym,即X的最后一個元素與Y的最后一個元素相同,這說明該元素一定位于公共子序列中。因此,現(xiàn)在只需要找:LCS(Xn-1,Ym-1)
LCS(Xn-1,Ym-1)就是原問題的一個子問題。為什么叫子問題?因?yàn)樗囊?guī)模比原問題小。
為什么是最優(yōu)的子問題?因?yàn)槲覀円业氖荴n-1和Ym-1的最長公共子序列啊。最長的!換句話說就是最優(yōu)的那個。
⑵如果xn!=ym,這下要麻煩一點(diǎn),因?yàn)樗a(chǎn)生了兩個子問題:LCS(Xn-1,Ym)和LCS(Xn,Ym-1)
因?yàn)樾蛄蠿和序列Y的最后一個元素不相等,那說明最后一個元素不可能是最長公共子序列中的元素。
LCS(Xn-1,Ym)表示:最長公共序列可以在(x1,x2,...xn-1)和(y1,y2,...,ym)中找。
LCS(Xn,Ym-1)表示:最長公共序列可以在(x1,x2,...xn)和(y1,y2,...,ym-1)中找。
求解上面兩個子問題,得到的公共子序列誰最長,那誰就是LCS(X,Y)。用數(shù)學(xué)表示就是:
LCS=max{LCS(Xn-1,Ym),LCS(Xn,Ym-1)}
由于條件⑴和⑵考慮到了所有可能的情況。因此,我們成功的把原問題轉(zhuǎn)化成了三個規(guī)模更小的問題。
②重疊子問題
重疊子問題是什么?就是說原問題轉(zhuǎn)化成子問題后,子問題中有相同的問題。
原問題是:LCS(X,Y)。子問題有❶LCS(Xn-1,Ym-1)❷ LCS(Xn-1,Ym)❸ LCS(Xn,Ym-1)
乍一看,這三個問題是不重疊的。可本質(zhì)上它們是重疊的,因?yàn)樗鼈冎恢丿B了一大部分。舉例:
第二個子問題:LCS(Xn-1,Ym)就包含了問題❶LCS(Xn-1,Ym-1),為什么?
因?yàn)椋?dāng)Xn-1和Ym的最后一個元素不相同時,我們又需要將LCS(Xn-1,Ym-1)進(jìn)行分解:分解成:LCS(Xn-1,Ym-1)和LCS(Xn-2,Ym)
也就是說:在子問題的繼續(xù)分解中,有些問題是重疊的。
由于像LCS這樣的問題,它具有重疊子問題的性質(zhì),因此:用遞歸來求解就太不劃算了。國為采用遞歸,它重復(fù)地求解了子問題,而且需要注意的是,所有子問題加起來的個數(shù)是指數(shù)級的。
那么問題來了,如果用遞歸求解,有指數(shù)級個子問題,故時間復(fù)雜度是指數(shù)級的。這指數(shù)級個子問題,難道用了動態(tài)規(guī)劃,就變成多項(xiàng)式時間了??
關(guān)鍵是采用動態(tài)規(guī)劃時,并不需要去一一計(jì)算那些重疊了的子問題。或者說:用了動態(tài)規(guī)劃之后,有些子問題是通過“查表”直接得到的,而不是重新又計(jì)算一遍得到的。舉個例子:比如求Fib數(shù)列。
求fib(5),分解成了兩個子問題:fib(4)和fib(3),求解fib(4)和fib(3)時,又分解了一系列的小問題...
從圖中可以看出:根的左右子樹:fib(4)和fib(3)下,是有很多重疊的!比如,對于fib(2),它就一共出現(xiàn)了三次。如果用遞歸來求解,fib(2)就會被計(jì)算三次,而用DP(Dynamic Programming)動態(tài)規(guī)劃,則fib(2)只會計(jì)算一次,其他兩次則是通過“查表”直接求得。而且,更關(guān)鍵的是:查找求得該問題的解之后,就不需要再繼續(xù)去分解該問題了。而對于遞歸,是不斷地將問題解,直到分解為基準(zhǔn)問題(fib(0)或者fib(1))
說了這么多,還是寫下最長公共子序列的遞歸式才完整。
C[i,j]表示:(x1,x2,...,xi)和(y1,y2,...,yj)的最長公共子序列的長度。公式的具體解釋可參考《算法導(dǎo)論》動態(tài)規(guī)劃章節(jié)
三、LCS Python代碼實(shí)現(xiàn)
#! /usr/bin/env python3# -*- coding:utf-8 -*-# Author : mayi# Blog : http://www.cnblogs.com/mayi0312/# Date : 2019/5/16# Name : test03# Software : PyCharm# Note : 用于實(shí)現(xiàn)求解兩個字符串的最長公共子序列def longestCommonSequence(str_one, str_two, case_sensitive=True): ''' str_one 和 str_two 的最長公共子序列 :param str_one: 字符串1 :param str_two: 字符串2(正確結(jié)果) :param case_sensitive: 比較時是否區(qū)分大小寫,默認(rèn)區(qū)分大小寫 :return: 最長公共子序列的長度 ''' len_str1 = len(str_one) len_str2 = len(str_two) # 定義一個列表來保存最長公共子序列的長度,并初始化 record = [[0 for i in range(len_str2 + 1)] for j in range(len_str1 + 1)] for i in range(len_str1): for j in range(len_str2): if str_one[i] == str_two[j]:record[i + 1][j + 1] = record[i][j] + 1 elif record[i + 1][j] > record[i][j + 1]:record[i + 1][j + 1] = record[i + 1][j] else:record[i + 1][j + 1] = record[i][j + 1] return record[-1][-1]if __name__ == ’__main__’: # 字符串1 s1 = 'BDCABA' # 字符串2 s2 = 'ABCBDAB' # 計(jì)算最長公共子序列的長度 res = longestCommonSequence(s1, s2) # 打印結(jié)果 print(res) # 4
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